基于全基因组测序的细菌耐药基因注释准确性与数据库比对效能验证

Journal: Frontier Forum of Clinical Medicine DOI: 10.32629/ffcr.v4i4.21473

王丽

贵州省疾病预防控制中心

Abstract

目的:探讨全基因组测序耐药基因注释准确性及数据库比对效能。方法:选取2024年8月至2025年8月60例细菌感染患者菌株,随机分为两组各30株;对照组用单一数据库BLAST比对,观察组用多数据库整合校验,均以表型药敏为金标准。结果:观察组注释准确率(93.33%)及各类耐药预测准确率均高于对照组(P<0.05);单株比对耗时(92.37±21.54)s短于对照组(186.45±32.18)s,耐药基因检出数、注释准确率、灵敏度、特异度均高于对照组(P<0.001)。结论:多数据库整合策略可提升耐药基因注释准确性与效能,利于临床应用。

Keywords

全基因组测序;耐药基因;注释准确性;数据库比对;表型药敏

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